實時熒光定量PCR實驗操作流程
一、實驗器材及試劑
1、 實驗器材
多樣品研磨珠均質(zhì)儀
臺式高速冷凍型微量離心機(jī)
熒光定量PCR儀
超凈工作臺
分光光度計
離心管
TIP頭
2、 主要實驗試劑及耗材
RNA提取液
三氯甲烷
異丙醇
無水乙醇
HyPure TMMolecular Biology Grade Water
RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit
FastStart Universal SYBR Green Master(Rox)
引物
75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制
離心管、TIP頭均購濕熱滅菌40min,干燥。
二、熒光定量PCR實驗步驟
1、總RNA抽提(槍頭和離心管均經(jīng)過濕熱滅菌,無RNA酶)
1)取勻漿器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上預(yù)冷。
2)取100mg組織,加入到勻漿器中。
3)充分研磨直至無可見組織塊。
4)12000rpm離心10min取上清。
5)加入250 μl三氯甲烷,顛倒離心管15s,充分混勻,靜置3min。
6)4℃ 下12000rpm離心10min。
7)將上清轉(zhuǎn)移到一新的離心管中,加入0.8倍體積的異丙醇,顛倒混勻。
8)-20℃ 放置15min。
9)4℃下12000rpm離心10min,管底的白色沉淀即為RNA。
10)吸除液體,加入75%乙醇1.5ml洗滌沉淀。
11)4℃下12000rpm離心5min。
12)將液體吸除干凈,將離心管置于超凈臺上吹3min。
13)加入15μl無RNA酶的水溶解RNA。
14)55℃ 孵育5min。
15)使用UV1800檢測RNA濃度及純度:儀器空白調(diào)零后取2.5μl 待測RNA溶液于檢測基座上,放下樣品臂,使用電腦上的軟件開始吸光值檢測。
16)將濃度過高的RNA進(jìn)行適當(dāng)比例的稀釋,使其終濃度為200ng/μl.左右。
2、反轉(zhuǎn)錄(槍頭和PCR均經(jīng)過濕熱滅菌,無RNA酶)
1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。
2)加入1μl 逆轉(zhuǎn)錄引物。
3)用無核糖核酸酶的去離子水補(bǔ)足至12μl。
4)于PCR儀上65℃ 保溫5min,迅速置冰上冷卻。
5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反轉(zhuǎn)錄酶,用槍抽吸混勻。
6)于PCR儀上42℃保溫60min,結(jié)束后80℃保溫5min滅活反轉(zhuǎn)錄酶。
3、定量PCR
1)取0.2ml PCR管,配制如下反應(yīng)體系,每個反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物配制3管。
2× qPCR Mix12.5μl
7.5μM基因引物2.0μl
反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2.5μl
ddH2O8.0μl
2)PCR擴(kuò)增
預(yù)變性95℃,10min
循環(huán)(40次) 95℃,15s→60℃,60s
熔解曲線75℃→95℃,每20s升溫1℃
4、結(jié)果處理
ΔΔCT法:
A=CT(目的基因,待測樣本)- CT(內(nèi)標(biāo)基因,待測樣本)
B=CT(目的基因,對照樣本)- CT(內(nèi)標(biāo)基因,對照樣本)
K=A-B
表達(dá)倍數(shù)=2-K