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實時熒光定量PCR實驗操作流程

一、實驗器材及試劑

1、 實驗器材

  • 多樣品研磨珠均質(zhì)儀

  • 臺式高速冷凍型微量離心機(jī)

  • 熒光定量PCR儀

  • 超凈工作臺

  • 分光光度計

  • 離心管

  • TIP頭

2、 主要實驗試劑及耗材

RNA提取液

三氯甲烷

異丙醇

無水乙醇

HyPure TMMolecular Biology Grade Water

RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit

FastStart Universal SYBR Green Master(Rox)

引物

75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制

離心管、TIP頭均購濕熱滅菌40min,干燥。


二、熒光定量PCR實驗步驟

1、總RNA抽提(槍頭和離心管均經(jīng)過濕熱滅菌,無RNA酶)

1)取勻漿器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上預(yù)冷。

2)取100mg組織,加入到勻漿器中。

3)充分研磨直至無可見組織塊。

4)12000rpm離心10min取上清。

5)加入250 μl三氯甲烷,顛倒離心管15s,充分混勻,靜置3min。

6)4℃ 下12000rpm離心10min。

7)將上清轉(zhuǎn)移到一新的離心管中,加入0.8倍體積的異丙醇,顛倒混勻。

8)-20℃ 放置15min。

9)4℃下12000rpm離心10min,管底的白色沉淀即為RNA。

10)吸除液體,加入75%乙醇1.5ml洗滌沉淀。

11)4℃下12000rpm離心5min。

12)將液體吸除干凈,將離心管置于超凈臺上吹3min。

13)加入15μl無RNA酶的水溶解RNA。

14)55℃ 孵育5min。

15)使用UV1800檢測RNA濃度及純度:儀器空白調(diào)零后取2.5μl 待測RNA溶液于檢測基座上,放下樣品臂,使用電腦上的軟件開始吸光值檢測。

16)將濃度過高的RNA進(jìn)行適當(dāng)比例的稀釋,使其終濃度為200ng/μl.左右。

2、反轉(zhuǎn)錄(槍頭和PCR均經(jīng)過濕熱滅菌,無RNA酶)

1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。

2)加入1μl 逆轉(zhuǎn)錄引物。

3)用無核糖核酸酶的去離子水補(bǔ)足至12μl。

4)于PCR儀上65℃ 保溫5min,迅速置冰上冷卻。

5)依次加入4μl  5×buffer,2μl  10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反轉(zhuǎn)錄酶,用槍抽吸混勻。

6)于PCR儀上42℃保溫60min,結(jié)束后80℃保溫5min滅活反轉(zhuǎn)錄酶。

3、定量PCR

1)取0.2ml PCR管,配制如下反應(yīng)體系,每個反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物配制3管。

2× qPCR Mix12.5μl

7.5μM基因引物2.0μl

反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2.5μl

ddH2O8.0μl

2)PCR擴(kuò)增

預(yù)變性95℃,10min

循環(huán)(40次)    95℃,15s→60℃,60s

熔解曲線75℃→95℃,每20s升溫1℃

4、結(jié)果處理

ΔΔCT法:

A=CT(目的基因,待測樣本)- CT(內(nèi)標(biāo)基因,待測樣本)

B=CT(目的基因,對照樣本)- CT(內(nèi)標(biāo)基因,對照樣本)

K=A-B

表達(dá)倍數(shù)=2-K