由SARS-CoV-2病毒引起的新冠肺炎如火如荼的在全球蔓延，全球已報道的感染人數(shù)超百萬。針對這次全球爆發(fā)的疫情，各國科研工作者們針對病毒感染機(jī)制、有效藥物篩選以及潛在藥物靶點進(jìn)行了大量研究。前期研究結(jié)果顯示病毒入侵依賴于ACE2、CD147以及TMPRSS2。

3月由美、英、法等國的研究者共同研究并在線發(fā)表了A SARS-CoV-2-Human Protein-Protein Interaction Map Reveals Drug Targets and Potential Drug Repurposing一文。

文中通過分析SARS-CoV-2病毒基因組信息，克隆表達(dá)了病毒的28個蛋白，包括4個結(jié)構(gòu)蛋白（S、M、N、E）、15個形成復(fù)制酶/轉(zhuǎn)錄酶復(fù)合體的非結(jié)構(gòu)蛋白（Nsp1、2、4-15及NSP5的突變體）以及9個假定輔助因子（Orf3a、3b、6、7a、7b、8、9b、9c、10）。然后用親和純化-質(zhì)譜分析法對每種病毒蛋白與人蛋白進(jìn)行蛋白相互作用（protein-protein interaction，PPI）分析，發(fā)現(xiàn)了332種高度可信的與病毒蛋白有相互作用的人靶蛋白。同時發(fā)現(xiàn)病毒蛋白與多種生物過程相關(guān)，包括蛋白轉(zhuǎn)運，翻譯，轉(zhuǎn)錄，泛素化調(diào)節(jié)等。

此后，通過系統(tǒng)的化學(xué)信息學(xué)藥物搜索和通路中心分析，發(fā)現(xiàn)在332個靶蛋白中的66種是有針對性調(diào)節(jié)藥物的，這些藥物包括FDA已批準(zhǔn)的、臨床試驗中的藥物以及臨床前化合物。研究者們目前正在檢測這些藥物的抗病毒活性。并同時希望通過本文的分析為開發(fā)廣泛有效的針對SARS-CoV-2和其他致命冠狀病毒株的抗病毒治療提供重要的分子靶點（見表1）。

圖1. SARS-CoV-2蛋白與人蛋白相互作用圖譜1

4月意大利的研究者在Journal of Clinical Medicine上發(fā)表了Master Regulator Analysis of the SARS-CoV-2/Human Interactome一文， 他們基于現(xiàn)有的SARS-CoV-2與宿主蛋白的相互作用組信息進(jìn)行了主調(diào)節(jié)因子分析（Master Regulator Analysis），發(fā)現(xiàn)病毒感染對人類相互作用組中的細(xì)胞凋亡、線粒體機(jī)制以及ACE2蛋白受體的下調(diào)影響最大。這些通路中的靶因子可用于開發(fā)針對病毒的治療方案（見表2）。

圖2. SARS-CoV2蛋白與人蛋白相互作用圖譜2

參考文獻(xiàn)鏈接：

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.22.002386v3.full

https://www.mdpi.com/2077-0383/9/4/982/htm

表1. 與SARS-CoV-2蛋白相互作用的人靶蛋白列表1

表2. 與SARS-CoV-2蛋白相互作用的人靶蛋白列表2