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一個與多種疾病有關的超家族:溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白家族

溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白(SLCs)超家族目前包括65個家族,439個轉(zhuǎn)運蛋白(不包括假基因),是人類基因組的第二大膜蛋白家族。它參與了細胞間的多種物質(zhì)運輸,包括糖、氨基酸、維生素、核苷酸、金屬、無機離子、有機陰離子、寡肽和藥物。由于SLCs是多種物質(zhì)進入或離開細胞的主要調(diào)節(jié)因子之一,因此它的運輸功能與多種疾病和機體免疫應答有關,如慢性疾病、精神障礙、心血管疾病和癌癥。目前,對溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白的研究已經(jīng)深入到人類疾病的各個領域,本文對部分SLCs與疾病的關系進行簡述。

 

圖1. SLC30A8蛋白結(jié)構(gòu)

(圖片來源于https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q8IWU4)

1. SLCs結(jié)構(gòu)和運輸機制

SLC的命名是根符號SLC加數(shù)字、字母和數(shù)字,如SLC3A1。SLCs轉(zhuǎn)運體與至少一個其他成員含有20%-50%同源性。迄今為止,已知結(jié)構(gòu)的SLCs預計包含1-16個跨膜(TM)結(jié)構(gòu)域,明顯的特征是跨核心TM域的偽對稱性。SLC中最常見的兩個結(jié)構(gòu)折疊是major facilitator superfamily(MFS)和leucine transporter(LeuT)樣折疊。

蛋白質(zhì)的物理結(jié)構(gòu)決定了其交替通路轉(zhuǎn)運的具體機制。膜輸送可分為被動和主動兩種,被動轉(zhuǎn)運可分為擴散和促進擴散,主動轉(zhuǎn)運包括初級主動轉(zhuǎn)運和二級主動轉(zhuǎn)運。SLCs的功能是促進擴散和二次主動運輸。二級活性轉(zhuǎn)運體利用預先存在的離子梯度作為能量來源,以相同或相反的方向運輸?shù)孜锖土硪粋€或多個溶質(zhì)(最典型的是離子)。例如,SLC1A2主要定位于星形膠質(zhì)細胞,負責90%以上的谷氨酸攝取,共轉(zhuǎn)運Na+和H+,反轉(zhuǎn)運K+,實現(xiàn)谷氨酸轉(zhuǎn)運。同向轉(zhuǎn)運體和反向轉(zhuǎn)運體是兩種二級活性轉(zhuǎn)運體,它們利用下坡離子梯度作為與底物運輸方向相同(同向轉(zhuǎn)運體)或相反(反向轉(zhuǎn)運體)的驅(qū)動力。這些轉(zhuǎn)運體的底物特異性不僅取決于氨基酸殘基和底物之間的相互作用,還取決于調(diào)節(jié)門控和/或選擇性元件的分子內(nèi)相互作用。

 

2. SLCs與疾病的關系

一些SLCs被發(fā)現(xiàn)具有組織特異性,對某些細胞類型發(fā)揮獨特的作用,最典型的例子是SLC6和SLC18家族的特定轉(zhuǎn)運蛋白,它們調(diào)節(jié)突觸中的神經(jīng)遞質(zhì)濃度。許多不同的SLCs家族也參與通過組織之間的選擇性屏障(如血腦屏障或腸道上皮)運輸營養(yǎng)物質(zhì),為它們提供必要的營養(yǎng)物質(zhì)。一些SLCs現(xiàn)在也被理解為受體,既作為細胞的轉(zhuǎn)運體又作為細胞的受體,使得轉(zhuǎn)運也作為細胞內(nèi)的信號系統(tǒng)。因此,有人認為SLCs參與遙感和信號轉(zhuǎn)導,這一假設表明SLCs和其他轉(zhuǎn)運蛋白通過其表達或活性的改變來調(diào)節(jié)細胞甚至組織功能。根據(jù)這一假設,轉(zhuǎn)運蛋白可參與器官間的信號傳遞。例如,與糖尿病密切相關的鋅轉(zhuǎn)運蛋白SLC30A8在胰腺細胞膜上高表達,轉(zhuǎn)運蛋白將鋅從細胞質(zhì)輸入到胰島素分泌顆粒中。隨后,胰島素和鋅的共同分泌不僅會影響鄰近的內(nèi)分泌細胞,而且鋅還會作為信號分子,抑制下游肝臟胰島素清除,從而使胰島素進入全身。

SLC3和SLC7,在功能上密切相關,這些家族的蛋白質(zhì)可以通過二硫橋連接,形成一種被稱為異聚氨基酸轉(zhuǎn)運體(HATs)的蛋白質(zhì)復合物,這些SLC3/SLC7二聚體促進了多種物質(zhì)的運輸。這些二聚體對于維持細胞的氧化還原平衡至關重要,在癌細胞中的表達增加可以使細胞減少氧化應激,避免細胞凋亡。

SCL26家族在胃腸道中尤為重要,在胃腸道中它們調(diào)節(jié)pH值,具有吸水性和特定底物的吸收或分泌。比如SLC26A1和SLC26A2是腸道中SO42-攝取的最大來源,分別定位于細胞的基底外側(cè)膜和頂端膜。SLC26A3是一種Cl-/HCO3-轉(zhuǎn)運體,對黏液膜和上皮組織的形成至關重要,有研究發(fā)現(xiàn)其表達在腺瘤中經(jīng)常下調(diào)。

SLC30家族的功能是降低細胞內(nèi)鋅的水平,而SLC39蛋白的功能是增加鋅的濃度。SLC39A4主要在腸道表達,其表達和定位受到轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后兩種方式的嚴格調(diào)控。SLC39A4也被證明在更具侵襲性的卵巢癌和胰腺癌中過表達,可能是對癌癥組織中鋅水平降低的反應。

 

圖2. 鋅轉(zhuǎn)運蛋白在不同時期B細胞中的作用

(圖片來源于《Acta Pharmaceutica Sinica B》雜志)

SLC8家族在細胞信號和內(nèi)穩(wěn)態(tài)中具有關鍵作用,它與不同的疾病有牽連,如癌的侵襲增加、糖尿病和異常的心臟信號。SLC24利用Na+和K+的電化學梯度來驅(qū)動Ca2+的流出,這些蛋白質(zhì)在許多不同的組織類型中表達,在光感受器、神經(jīng)元和平滑肌細胞中較多。SLC24A4以及SLC8A3,已經(jīng)被證明在治療耐藥的卵巢癌細胞中過表達。

SLC22家族及其轉(zhuǎn)運底物在癌癥的發(fā)生發(fā)展中具有廣泛的作用。該家族成員在胰腺癌和肝癌患者組織中均有下調(diào)(SLC22A1, SLC22A2, SLC22A11)和上調(diào)(SLC22A3和SLC22A18),不同的轉(zhuǎn)運蛋白對蛋白的長期生存有不同的影響。SLC22A6轉(zhuǎn)運蛋白的表達受到癌癥治療方案的影響,甲氨蝶呤會下調(diào)該蛋白。同樣,用于治療慢性髓系白血病的藥物伊馬替尼也能改變SLC22A1的表達。SLC14家族只包含2個不同的基因,SLC14A1和SLC14A2,這兩個轉(zhuǎn)運蛋白的主要功能是在腎臟中濃縮尿素,使尿素排泄,并通過尿素在細胞膜上的被動運動重新吸收水分。

 

3. SLCs的表達

盡管所有的膜蛋白加在一起約占整個蛋白質(zhì)組的三分之一和目前所有治療靶點的三分之二,但已闡明的膜蛋白結(jié)構(gòu)的數(shù)量非常少,迄今為止在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(PDB)中保存了約280種獨特的結(jié)構(gòu)(可從www.rcsb.org/獲得),占所有可用3d分辨率結(jié)構(gòu)的不到1%。嵌入在磷脂雙分子層中的整體膜蛋白的疏水片段,使膜蛋白難以表達和結(jié)晶。由于這個問題,膜蛋白的結(jié)構(gòu)確定一直被認為是一個非常困難的任務。

云克隆開發(fā)了上述研究中涉及的相關指標的蛋白、抗體、ELISA試劑盒等產(chǎn)品以助力腫瘤治療相關研究,部分指標的抗體檢測結(jié)果如下:

 

圖3. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 3, Member 2(SLC3A2)

 

圖4. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 30 Member 8(SLC30A8)

 

圖5. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 30, Member 3 (SLC30A3)

云克隆SLCs超家族相關指標:

指標名

核心貨號

指標名

核心貨號

OSTb

C697

SLC26A4

E474

OSTa

F705

SLC26A6

E476

OSCP1

G601

SLC26A7

E477

SLC1A5

E345

SLC30A1

E487

SLC3A2

E348

SLC30A3

G575

SLC6A11

P673

SLC30A4

E488

SLC7A11

E410

SLC30A5

G576

SLC7A9

E419

SLC30A6

G577

SLC10A3

E423

SLC30A7

E489

SLC10A7

E424

SLC30A8

E490

SLC16A1

E431

SLC30A10

N188

SLC16A2

E432

SLC34A1

E495

SLC16A3

E433

SLC34A2

G571

SLC16A4

E434

SLC35B4

E499

SLC16A8

G592

SLC39A4

E484

SLC22A9

E449

SLC39A6

E486

SLC22A11

E450

SLC39A7

E485

SLC22A18

E452

SLCO1A2

E516

SLC24A5

E440

SLCO3A1

E520

SLC25A13

E463

SLCO4A1

E521

SLC25A39

E457

SLCO1B2

S904

 

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參考文獻:

1. Pizzagalli MD, Bensimon A, Superti-Furga G. A guide to plasma membrane solute carrier proteins. FEBS J. 2021 May;288(9):2784-2835. doi: 10.1111/febs.15531. Epub 2020 Sep 18. PMID: 32810346; PMCID: PMC8246967.

2. Hu C, Tao L, Cao X, Chen L. The solute carrier transporters and the brain: Physiological and pharmacological implications. Asian J Pharm Sci. 2020 Mar;15(2):131-144. doi: 10.1016/j.ajps.2019.09.002. Epub 2019 Nov 13. PMID: 32373195; PMCID: PMC7193445.