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TRET激活靶向DNA甲基化和多重衰老特征

生物體衰老的特征是生理完整性和適應(yīng)性的時(shí)間依賴性喪失。這一特征是由多種、重機(jī)制共同驅(qū)動(dòng)的,通過導(dǎo)致細(xì)胞損傷的積累,最終引起器官功能和組織穩(wěn)態(tài)下降。端粒功能障礙是衰老的主要標(biāo)志,端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT)基因的低轉(zhuǎn)錄會(huì)引起端粒酶活性不足,從而引發(fā)端粒功能障礙和衰老相關(guān)疾病。此外,TERT還作為衰老和年齡相關(guān)疾病關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄共調(diào)節(jié)劑。然而,TERT的下游作用機(jī)制仍未得以闡明。最近,美國(guó)德克薩斯大學(xué)團(tuán)隊(duì)在《Cell》上發(fā)表了題為“TERT activation targets DNA methylation and multiple aging hallmarks”的文章。研究中,作者鑒定報(bào)道了一種TERT激活劑化合物(TAC),該化合物通過MEK/ERK/AP-1級(jí)聯(lián)上調(diào)TERT轉(zhuǎn)錄。在人的原代細(xì)胞和自然衰老高齡小鼠中,TAC誘導(dǎo)的TERT水平升高能促進(jìn)端粒合成,并能通過減少細(xì)胞衰老和炎癥細(xì)胞因子來減弱組織衰老標(biāo)志,同時(shí)通過上調(diào)甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT3B介導(dǎo)的啟動(dòng)子超甲基化來沉默衰老標(biāo)志基因p16INK4a的表達(dá)。在人腦中,TAC減輕神經(jīng)炎癥,增加神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子,刺激成年人神經(jīng)發(fā)生,并保持認(rèn)知功能,而沒有明顯的毒性,包括癌癥風(fēng)險(xiǎn)??傊?,這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了TERT在衰老過程中的關(guān)鍵作用,并為TERT生理激活作為減輕多種衰老特征和相關(guān)病理的策略提供了臨床前證明。這將會(huì)對(duì)阿爾茨海默病、帕金森病等年齡相關(guān)疾病產(chǎn)生積極治療意義。

 

 

首先,研究者通過基于細(xì)胞的高通量篩選(HTS)法,以大規(guī)模篩選在成年轉(zhuǎn)基因(hTERT)小鼠耳成纖維細(xì)胞中調(diào)節(jié)人TERT轉(zhuǎn)基因體內(nèi)轉(zhuǎn)錄活性的小分子。最終,通過Rluc熒光素酶報(bào)告基因的測(cè)量表征了大約100個(gè)位點(diǎn)。鑒定出了幾種能夠誘導(dǎo)TERT基因轉(zhuǎn)錄活性的TCAs。免疫印跡分析表明,篩選的TAC能誘導(dǎo)TERT蛋白的最高表達(dá)。因此選擇它進(jìn)行進(jìn)一步的分析。另外,TAC處理能誘導(dǎo)原代人成纖維細(xì)胞MRC5中TRET mRNA水平的依賴性升高。一致的是,TAC處理導(dǎo)致TERT基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游活性增強(qiáng)子/啟動(dòng)子標(biāo)記H3K27ac的積累和抑制標(biāo)記H3K9me3的缺失,表明TAC可以覆蓋調(diào)控人TERT基因座的染色質(zhì)狀態(tài)。此外,TAC能增加hTERT-Rluc轉(zhuǎn)基因小鼠的多個(gè)組織(包括腦、心臟和骨骼?。┲腥祟?em>TERT基因的表達(dá)。對(duì)原發(fā)性維爾納綜合癥(WS)成纖維細(xì)胞中TAC活性的評(píng)估結(jié)果表明,可以通過強(qiáng)制hTERT的表達(dá)來逆轉(zhuǎn)這些細(xì)胞的快速衰老。且TAC(0.5mM)能夠誘導(dǎo)WS成纖維細(xì)胞中TERT的表達(dá)。在該WS模型中,定量PCR和熒光原位雜交(FISH)分析均顯示,相對(duì)于對(duì)照組,長(zhǎng)期TAC處理導(dǎo)致內(nèi)源性端粒長(zhǎng)度增加。這表明TAC/ TERT介導(dǎo)的端粒添加能有效地修復(fù)短端粒的DNA損傷,并且人原代成纖維細(xì)胞保留了增殖能力。

 

圖1. TERT小分子激活劑的鑒定

為了進(jìn)一步研究下游信號(hào)級(jí)聯(lián)和與TAC誘導(dǎo)TERT表達(dá)相關(guān)的TERT啟動(dòng)子原件,研究者們首先使用磷酸激酶陣列分析了激酶極其底物的磷酸化譜。發(fā)現(xiàn)在人原代MRC5細(xì)胞中,TAC處理后細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶(ERK)及其下游效應(yīng)物S6激酶的磷酸化持續(xù)增加。因此,用MEK激酶抑制劑抑制ERK可消除TAC誘導(dǎo)的MRC5細(xì)胞中ERK的磷酸化和TERT上調(diào)。

接下來,他們研究了不同體細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化,以闡明將ERK激活與TERT轉(zhuǎn)錄控制聯(lián)系起來的潛在轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合元件。通過對(duì)人類正常成纖維細(xì)胞和誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)衍生神經(jīng)元的轉(zhuǎn)錄組分析,研究者觀察到,TAC(0.5mM, 1h)急性處理導(dǎo)致兩種人類細(xì)胞類型中只有有限數(shù)量的常見基因被顯著誘導(dǎo)。其中,FOSSOGA3,在處理后的兩種細(xì)胞類型中都表現(xiàn)出顯著的上調(diào)。FOS編碼活化蛋白1 (AP-1)轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的主要成分,在兩種細(xì)胞中被鑒定為受TAC調(diào)控最顯著的基因。這證明TAC處理能特異性誘導(dǎo)TERT表達(dá)及其下游轉(zhuǎn)錄效應(yīng)。作者同時(shí)發(fā)現(xiàn)位于人類TERT基因上4kb調(diào)控區(qū)域內(nèi)有兩個(gè)AP-1結(jié)合位點(diǎn)。隨后,作者構(gòu)建了一個(gè)包含來自TERT基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的4kb上游序列的人TERT啟動(dòng)子-熒光素酶報(bào)告子,以探究TERT啟動(dòng)子激活是否需要AP-1基序。轉(zhuǎn)染MRC5細(xì)胞后,用TAC刺激細(xì)胞能夠誘導(dǎo)人成纖維細(xì)胞的TERT報(bào)告活性。且單缺失和雙缺失AP-1基序都能顯著消除TAC誘導(dǎo)的TERT啟動(dòng)子活性。染色質(zhì)免疫沉淀和實(shí)時(shí)定量PCR (ChIP-qPCR)分析顯示,TAC處理導(dǎo)致內(nèi)源性AP-1復(fù)合物亞基FOS募集到內(nèi)源性TERT啟動(dòng)子中的兩個(gè)AP-1結(jié)合基序??傊@些數(shù)據(jù)表明,TAC通過MEK/ERK/AP-1途徑特異性激活TERT的轉(zhuǎn)錄。

 

圖2. TAC激活MEK/ERK/AP-1級(jí)聯(lián),上調(diào)TERT基因轉(zhuǎn)錄

接下來,作者評(píng)估了TAC介導(dǎo)的TERT誘導(dǎo)是否能減輕端粒完好的老年小鼠的機(jī)體衰老。對(duì)12月齡小鼠外周血單個(gè)核細(xì)胞的RNA測(cè)序結(jié)果顯示,TAC處理的中年小鼠外周血中TERT蛋白水平顯著升高。經(jīng)過1周的治療,發(fā)現(xiàn)TAC處理組中和小鼠衰老相關(guān)的關(guān)鍵特征顯著減少。如衰老關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因子p16Ink4a以及其它和衰老相關(guān)的分泌表型(SASP)成分-IL-1α,IL-1β,Mmp-3Vegf 等都表現(xiàn)出明顯的減少。相反,TAC處理能同時(shí)誘導(dǎo)生物體中生長(zhǎng)和自然殺傷細(xì)胞激活。而這些特征在正常小鼠中是隨著年齡增長(zhǎng)而下降的。在TERT缺失的小鼠中,TAC介導(dǎo)的p16Ink4a抑制被消除。表明TERT對(duì)TAC誘導(dǎo)的p16Ink4a沉默是必需的。對(duì)Tert+/+、Tert+/- Tert-/-小鼠大腦的定量RT-PCR分析證實(shí)Tert+/-小鼠的DNMT3b甲基化轉(zhuǎn)移酶的水平明顯下調(diào),Tert-/-小鼠的DNMT3b水平進(jìn)一步下調(diào),表明TERT水平和體內(nèi)Dnmt3b表達(dá)呈正相關(guān)。相應(yīng)地,ChIP測(cè)序分析表明,TERTDNMT3b啟動(dòng)子結(jié)合。這些結(jié)果表明,TERT不僅在高增殖細(xì)胞中,而且在終末分化細(xì)胞中也可作為轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)劑。

鑒于DNMT3b介導(dǎo)的DNA甲基化與p16INK4a轉(zhuǎn)錄抑制有關(guān),研究者們隨后探究了TAC治療是否能夠誘導(dǎo)體內(nèi)p16InkK4a啟動(dòng)子的高甲基化。結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,TAC治療后中年小鼠組織中p16InkK4a啟動(dòng)子區(qū)域甲基化的CpG位點(diǎn)顯著增加。此外,給予TAC治療6個(gè)月能減少老年小鼠多組織中衰老細(xì)胞的負(fù)荷,增加促炎癥因子的產(chǎn)生。因此,TAC驅(qū)動(dòng)的TERT上調(diào)減少了年齡依賴性組織衰老,并調(diào)節(jié)了細(xì)胞衰老的主要遺傳驅(qū)動(dòng)因素,包括p16InkK4a和SASP成分。

 

 

圖3. TAC可在體內(nèi)減弱多種衰老特征

為了進(jìn)一步了解TAC對(duì)基因表達(dá)程序的影響,對(duì)中年(約12- 14月齡)C57BL/6小鼠的海馬組織進(jìn)行了RNA-seq分析,這些小鼠分別接受了載藥或TAC治療3周。值得注意的是,TAC治療誘導(dǎo)了與成人海馬神經(jīng)發(fā)生和大腦功能正相關(guān)基因的表達(dá)顯著增加。此外,通路富集分析顯示,TAC治療導(dǎo)致中年小鼠海馬突觸電位、軸突引導(dǎo)、海馬/干細(xì)胞發(fā)育、端粒維持、神經(jīng)母細(xì)胞增殖、多巴胺能神經(jīng)發(fā)生/中樞神經(jīng)系統(tǒng)神經(jīng)元分化和絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)家族信號(hào)級(jí)聯(lián)相關(guān)通路的激活。相反,和衰老相關(guān)的細(xì)胞因子和炎癥因子在TAC處理下都顯著下調(diào)。免疫組織化學(xué)和免疫熒光分析顯示,TAC治療4周顯著增加了海馬齒狀回(DG)中表達(dá)DXC的新生神經(jīng)元的數(shù)量。這表明TAC確實(shí)可以增強(qiáng)老年大腦的再生能力。因此,TERT的藥理激活誘導(dǎo)了與返老還童相關(guān)的基因特征,并刺激了成年小鼠海馬體中的成年神經(jīng)發(fā)生。

慢性神經(jīng)炎癥是大腦衰老的普遍特征,膠質(zhì)細(xì)胞是大腦神經(jīng)炎癥的主要參與者,小膠質(zhì)細(xì)胞的激活被認(rèn)為是大多數(shù)大腦衰老和神經(jīng)退行性疾病中可見的神經(jīng)炎癥的標(biāo)志。與對(duì)照組相比,TAC給藥顯著降低了衰老小鼠大腦中IBA1陽性激活的小膠質(zhì)細(xì)胞水平。在TAC處理的海馬組織中,包括IL-1β、IL-6TNF-α在內(nèi)的促炎細(xì)胞因子的含量也相對(duì)于對(duì)照組有所減少。經(jīng)過6個(gè)月的治療,接受TAC治療的老年小鼠在三個(gè)海馬依賴性認(rèn)知測(cè)試-巴恩斯迷宮和新位置識(shí)別任務(wù)中的表現(xiàn)都有明顯改善??傊@些發(fā)現(xiàn)表明,適度的tac誘導(dǎo)內(nèi)源性TERT水平的增加不僅改善了老年小鼠海馬依賴的認(rèn)知功能,還增強(qiáng)了神經(jīng)肌肉功能,而沒有任何明顯的不良后果。

圖4. 長(zhǎng)期TAC給藥可改善大腦衰老

 

本研究強(qiáng)調(diào)了衰老器官系統(tǒng)的顯著再生能力,以及在自然衰老過程中藥理學(xué)調(diào)節(jié)衰老特征的能力。研究報(bào)告發(fā)現(xiàn)了一種新的小分子端粒酶激活劑TAC,該激活劑可誘導(dǎo)TERT在人和小鼠體細(xì)胞組織中的生理表達(dá)。TAC能有效地抵消成人體細(xì)胞中TERT基因的表觀遺傳沉默,從而影響控制衰老標(biāo)志的基因的表達(dá)。值得注意的是,TAC處理顯著減少了不同組織中衰老細(xì)胞的比例。同時(shí),DNMT3B介導(dǎo)的主細(xì)胞死亡基因p16Ink4a的抑制以TERT依賴的方式進(jìn)行。此外,在老年小鼠中長(zhǎng)期給予腦滲透TAC可減少神經(jīng)炎癥和炎癥細(xì)胞因子,增強(qiáng)與年輕化相關(guān)的基因特征,促進(jìn)成年神經(jīng)發(fā)生,并在沒有明顯副作用的情況下保持認(rèn)知功能。因此,生理TERT激活有望緩解小鼠自然衰老過程中的衰老表型。

圖5. TAC/TERT驅(qū)動(dòng)的抗衰老效果示意圖

云克隆開發(fā)了外泌體研究中涉及到的相關(guān)靶標(biāo)的蛋白、抗體以及試劑盒產(chǎn)品。靶標(biāo)及核心貨號(hào)如下,供參考: